Back from Reproducible Days organized by French network

It was a very pleasant parenthesis in the middle of my parenthesis. I enjoyed the talks, many discussions around coffee, lunch or diner. So much food for thoughts! The topic of Reproducible Research in our modern are is a true twofold challenge: scrutinize why now it appears as a real concern and act on what we have.

We are all hitting hard-to-reproduce roadblocks in our day-to-day practises when trying to push the boundaries of the understanding of our specialized fields; and all fields are impacted, to some extent.

The picture for the specificities of each field or for the common between all cannot be drawn in the abstract, instead it must be rooted in current practises. The challenge is both: being reflective and incremental. What a topic!

Les Journées du réseau français de recherche reproductible 2024 se sont déroulées à Grenoble du 26 au 28 Mars. À la suite de ces journées, j’ai envoyé un email pour réfléchir à l’axe du Groupe de Travail (GT) sut la reproductibilité du procédé de calculs.

Voilà je pose cet email là comme un pense bête.




L’idée de cet email est d’essayer de borner les axes de travail pour le GT Reproductibilité Logicielle. Voilà ce à quoi je pensais nourri par ces 3 journées à Grenoble ! D’ailleurs, merci pour l’organisation !

D’abord limiter logiciel en excluant Données ; logiciel comme un ensemble de séquences d’instructions exécutées par un calculateur.

Quelque part restreindre le GT à la question de la reproductibilité du procédé de calculs. Donc je propose de travailler sur trois axes dans le désordre ou mélangés :

Bien évidemment, j’ai un fort biais (Guix) pour approcher le problème de la « Reproductibilité Logicielle ». Le sujet est d’apporter collectivement des pistes / discussions / réponses et pas de propager mes biais. ;-)

Si ces 3 axes vous paraissent “raisonnables”, on pourrait commencer par se fixer comme objectif la construction de synthèses comme base de (re-)discussions avec les collègues, sous la forme de transparents/présentation et/ou guide et/ou recommendations, bref à définir.

Concrètement, aujourd'hui quand j'écris un papier, et ayant mis les mains dans le cambouis de la Reproductibilité Logicielle, je me sens quand même un peu démuni face à la capture (identification) de la chaine de traitements que j'applique sur les données. Il n'est pas clair pour moi ce qui fonctionne, un peu plus clair ce qui ne fonctionne pas, bref pour commencer le Groupe de Travail pourrait collecter et synthétiser, et peut-être proposer, des pistes de réponses à la question : comment identifier ou décrire ou citer une chaine de traitements ?




Footnotes:

1

Suggestion de Thomas Vuillaume. Merci !


© 2014-2024 Simon Tournier <simon (at) tournier.info >

(last update: 2024-06-05 Wed 09:47)